miRNAs参与养血柔肝法治疗骨关节炎的生物信息学分析

来源 :大连医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dongxiaohu123
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目的分析miRNAs在养血柔肝法"养血软坚胶囊"治疗骨关节炎中的生物学信息。方法将40只SD大鼠进行前交叉切除(ACLT)造模成骨关节炎模型,模型验证造模成功后,随机分为模型组(n=20)和中药组(n=20)。模型组不干预,中药组予大鼠灌胃饲养,药物采用养血柔肝法中成药养血软坚胶囊。4周后取材,提取关节软骨组织的RNA,制备文库,通过数据预处理、测序错误率分布检查、测序数据过滤、差异表达的miRNAs的鉴定、差异表达的miRNA的靶基因的鉴定、差异表达的miRNA的靶基因的功能分析、网络图构建等步骤,对差异表达的miRNAs进行数据分析。并RT-PCR验证所得结果。结果中药组与模型组并共有35个miRNAs表达有差异。其中7个上调(共调控了1174个靶基因),28个下调(共调控了2216个靶基因);对差异miRNAs的靶基因进行蛋白互作网络分析(PPI)后,通过连接度最高的几个节点,获得了19个重要的靶基因。关节软骨中,中药组rnomiR-199a-5p、rno-miR-140-3p的表达高于模型组,中药组rno-miR-300-3p、rno-miR-9a-3p的表达低于模型组,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论养血柔肝法中药"养血软坚胶囊"可以调控骨关节炎大鼠模型的miR-199a-5p,miR-140-3p,miR-300-3p和miR-9a-3p等miRNAs。
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