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3-吲哚乙酸甲基转移（IAMT）催化甲基化植物激素3-吲哚乙酸（IAA）的端位自由羧酸,被认为在叶片发育过程中起到了至关重要的作用.然而,目前对于酶催化机理的详尽过程尚未被研究。在这里本文对拟南芥的甲基转移过程（AtIAMT1）进行结合量子力学和分子力学（QM/MM）的自由能模拟,并确定了其催化机制及IAMTs的底物特异性根源.研究表明,从S腺苷L甲硫氨酸（AdoMet）到3-吲哚乙酸盐（IAA）的甲基转移自由能垒要比从AdoMet到水杨酸盐的自由能垒低很多,这与之前的实验发现以及酶的底物特异性完全一致.