基于GEO数据库对慢性乙型肝炎中关键miRNAs筛选及其生物信息学分析

来源 :山东医药 | 被引量 : 0次 | 上传用户：cshuangyong

【摘要】

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目的应用生物信息学方法分析miRNAs在慢性乙型肝炎(CHB)肝组织中的表达变化及生物学功能。方法在GEO数据库中获取GSE110217芯片数据,使用R语言筛选差异表达的miRNAs;使用miRD

【作者】

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王庆辉钱惠忠张媛媛夏卫刘晓郝庆钦

【机构】

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无锡市中心血站

【出处】

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山东医药

【发表日期】

：

2020年26期

【关键词】

：

乙型肝炎病毒慢性乙型肝炎 MIRNAS GEO数据库生物信息学 hepatitis B viruschronic hepatitis BmiRNAsGEO

【基金项目】

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江苏省无锡市科技局科技发展计划项目(WX18ⅡAN037),江苏省无锡市卫生健康委科研项目(MS201925)

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目的应用生物信息学方法分析miRNAs在慢性乙型肝炎(CHB)肝组织中的表达变化及生物学功能。方法在GEO数据库中获取GSE110217芯片数据,使用R语言筛选差异表达的miRNAs;使用miRDB、miRTarBase、TargetScan数据库预测其靶基因,进一步采用DAVID软件对目的基因进行生物学功能(GO)分析,利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对基因进行生物通路富集分析,筛选靶基因所涉及的有意义的生物学功能和通路靶基因;采用String和Cytoscape软件进行靶基因蛋白相互作用

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