人NOD2蛋白的生物信息学分析

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[目的]对人NOD2蛋白进行生物信息学分析,预测其结构和功能,为儿童癫痫与肠道菌群之间的关系提供试验基础。[方法]利用生物信息学工具对人NOD2蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区域、空间结构、亚细胞定位、信号肽、磷酸化位点进行预测。[结果]人NOD2蛋白由1 013个氨基酸残基组成,相对分子质量112 530.04 Da,等电点为6.59,分子式为C5033H7960N1402O1428S49,带负电荷的残基总数(天冬氨酸+谷氨酸) 103个,带正电荷的残基总数(精氨酸+赖氨酸) 96个,蛋白不稳定系数为48.75,脂肪系数为101.46,总平均亲水性系数为0.008。二级结构由54.59%的α-螺旋、10.07%的延伸链、5.73%的β-转角、29.62%的无规卷曲构成。亚细胞被确认为定位在细胞膜、细胞质和线粒体中。[结论]人NOD2蛋白是一种不含信号肽和跨膜区的疏水性蛋白,具有激酶活性。该研究为探讨儿童癫痫与肠道菌群及炎症之间的关系提供了依据。
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