结核性胸膜炎患者胸膜组织中环状RNA表达谱初步分析

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目的:分析结核性胸膜炎患者胸膜组织中环状RNA(circRNA)的表达谱,并预测其靶基因,初步探讨circRNA与结核性胸膜炎的关系。方法:本研究纳入了结核性胸膜炎患者和对照组各13例,所有患者均通过胸腔镜进行胸膜活检。应用高通量测序技术对结核性胸膜炎组织与正常胸膜组织各3例进行circRNA检测,用edgeR对基因进行了差异表达分析,剩余标本进行实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证,用miRanda软件预测差异表达circRNA相关的微小RNA(miRNA)。结果:高通量测序结果显示,结核性胸膜炎组织中存在差异表达的circRNA有134个,其中53个表达上调,81个表达下调。挑选6个有显著差异的circRNA进行qRT-PCR验证,结果显示hsa_circ_0008433在结核性胸膜炎组织中的表达上调(n P<0.05),hsa_circ_0008234、hsa_circ_0001368在结核性胸膜炎组织中的表达下调(n P<0.05),结果与高通量测序结果一致。其余3个circRNA的表达水平差异无统计学意义。miRanda软件预测hsa-miR-17、hsa-miR-20b-3p等是hsa_circ_0008234的靶基因,其可能在结核性胸膜炎的发生发展中起调控作用。n 结论:结核性胸膜炎患者胸膜组织中circRNA表达谱发生了变化,这些差异表达的circRNA可能与结核性胸膜炎的发生发展密切相关。
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