目的：探讨肝硬化患者肠道菌群的临床特征及有效的药物治疗方法。方法：选择我院2014年1月～2015年1月间收录的患有肝硬化患者共40例，并于同期选择非器质性病变体检者40例，对以上肝硬化患者及体检者粪便内细菌菌株进行分离培养，作为观察组及对照组，对比2组菌株的临床特征及其药物应用效果。结果：肝硬化患者奥菌群PCR检查大肠埃希菌、双歧杆菌、肠球菌及乳酸杆菌均为检测阳性，有扩增现象。细菌显微培养所培养出肠道菌群与PCR检测所得结果相同。2组患者粪便中，经临床细菌显微镜下检查发现，肝硬化患者粪便中有大量细菌潜生体和繁殖体，其细菌集群率为55％，相比较非肝硬化组患者粪便中仅有少量细菌潜生体和繁殖体，其细菌集群率为10％。经临床观察发现，显微培养中的细菌菌群8小时后均出现细菌潜生体和繁殖体，细菌运动方式有定向运动及灵活运动。未应用治疗药物细菌群集率为100％，其中潜生体检出率为96％；应用蜡样芽孢杆菌微生态制剂细菌群集率为61％，其潜生体检出率为53％；应用培菲康双奇三联活菌制剂细菌群集率为51．5％，其潜生体检出率为30．3％；两者同时应用，其细菌群集率为8．6％，其潜生体检出率为5．1％。结论：蜡样芽孢杆菌微生态制剂及培菲康双岐三联活菌制剂在肝硬化患者肠道菌群的联合应用，临床治疗效果显著，具有临床进一步应用研究的价值。