葡萄Trihelix转录因子家族的生物信息及其基因表达分析

来源 :园艺学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yzhyzhyzh
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
利用生物信息学分析、预测葡萄Trihelix转录因子家族基因的特性与功能,为葡萄抗逆基因资源的挖掘和利用提供理论依据。以‘红地球’(Vitis vinifera)试管苗为试验材料,运用生物信息学对葡萄Trihelix转录因子家族进行理化性质、染色体定位、二级结构预测、亚细胞定位、基因结构分析、motif以及基因芯片表达分析,并利用qRT-PCR技术分析该家族基因在400 mmol·L-1 NaCl、100 mmol·L-1 ABA和10%PEG逆境下的表达情况。结果表明,该转录因子家族在葡萄基因组中总共有27个成员,分布于11条染色体上,其中有9个成员集中分布在第14和17号染色体上;氨基酸大小主要在175-880 aa之间,大多数具有疏水性。亚细胞定位分析表明,该基因家族主要存在于细胞核中。结构域分析显示,同一亚家族基因保守域结构高度相似。基因芯片表达结果显示,非生物胁迫下,VvTrihelix6在PEG处理8 h后与对照相比呈上调趋势,当处理24 h后,有下调表达趋势;当用ABA处理果实3 d后,该基因在果实中呈下调表达,处理10 d后变化不明显。VvTrihelix19转录因子用PEG和盐处理24 h后呈明显下调趋势;用ABA处理3 d和10 d后均有明显下调趋势。q RT-PCR分析该转录因子家族所有基因对逆境胁迫具有响应作用,但是,该基因家族成员在不同逆境胁迫下的响应程度存在一定的差异。转录因子VvTrihelix6在400 mmol·L-1 NaCl和100 mmol·L-1 ABA处理下表达量极显著高于对照;分别是对照的15倍和8倍;VvTrihelix19只在10% PEG胁迫处理后呈显著上调表达。
其他文献
电缆是短距离内信号控制和电能输送的主要载体,是电子设备的重要组成部分之一,其质量直接影响着系统的整体性能与可靠性,电缆故障是大型系统故障的主要原因之一。但目前国内
聋校语文教学必须立足并突出语文的工具性,在此基础上发展人文性。工具性是聋校语文教学的起点,是聋生一切发展的基础。人文性是语文教育追求的目标,是聋校语文教育实现终极
对于自然资源,宪法上的"国家所有"不能简单认为是国家通过占有自然资源而直接获取其中的利益,而首先应理解为国家必须在充分发挥市场的决定作用基础下,通过使用负责任的规制
<正>作为国际上一门新兴的肿瘤学与心血管病学交叉学科,肿瘤心脏病学(Onco-Cardiology)的主要研究领域包括心血管疾病与肿瘤共有的危险因素和干预、抗肿瘤治疗导致的心血管并
目的:介绍采用改良的经右胸三尖瓣置换术治疗左心瓣膜置换术后孤立性三尖瓣反流的经验。方法:在传统经右胸三尖瓣置换术的基础上,进一步采用带气囊气管导管作为上下腔静脉引
<正>一、自我评定一)自我分析我出生在江苏省连云港市的一个农村家庭。父亲是教师,但家里仍有几亩农田。父亲知识分子和农民的双重身份深深影响着我,不仅让我吸收了知识的精
人体在不同时期体内所含水的比重也有所不同:幼儿时期约占80%,成年期约占70%,老年期约占60%[1],从这里可以看出人体的衰老过程实际上就是水分流失的过程,水健康成为人体生命
雾霾的形成除一定的自然因素外,还与工业废气的排放、大量燃烧煤炭以及机动车尾气的排放有关。近年来黑龙江省频频遭受雾霾的袭击,虽然政府出台了一系列治理雾霾的措施,但基
随着社会经济的不断发展,各大中小型城市现代化建设进程加快,居民的收入水平增长,对于各类基础设施的需求与要求也在增加。这促进了土木工程施工项目的产生与发展,而土木工程