【摘 要】
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目的:采用分子动力学模拟方法研究胰高血糖素样肽-1受体(GLP-1R)的激活机制.方法:分别构建激活态和失活态的GLP-1R结构,置于棕榈酰-油酰-卵磷脂(POPC)双层膜内,进行50 ns的分
【机 构】
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天津医科大学药学院,天津300070;天津药物研究院天津市新药设计与发现重点实验室,天津300450;天津药物研究院天津市新药设计与发现重点实验室,天津300450
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目的:采用分子动力学模拟方法研究胰高血糖素样肽-1受体(GLP-1R)的激活机制.方法:分别构建激活态和失活态的GLP-1R结构,置于棕榈酰-油酰-卵磷脂(POPC)双层膜内,进行50 ns的分子动力学模拟,比较不同体系的构象并进行氢键、能量、主成分等性质分析.结果:结果表明失活态的胞外域整体倒向跨膜区,激活态和失活态的胞内第三loop(ICL3)构象差异明显,可见ICL3在GLP-1R的激活中扮演着重要角色.氢键和能量分析结果均表明胰高血糖素样肽-1(GLP-1)的His7*,Glu9*和Asp15*在与GLP-1R的结合中起着较为重要的作用.结论:分子动力学模拟作为辅助手段可用于研究GLP-1R构象变化对其自身激活的影响以及GLP-1与受体结合时的激活机制,为以GLP-1R为靶点的药物研发提供一定的理论指导.
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