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目的：应用比较蛋白质组学方法分析正常乳腺与乳腺癌组织的差异表达核基质蛋白，为人乳腺癌发病机制及其早期诊断的研究提供理论依据．方法：应用双相电泳（2-DE）每组分离4例乳腺组织核基质蛋白；应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）获得差异蛋白点的肽质量指纹图谱（PMF）；通过Mascot软件查询NCBI数据库鉴定蛋白质．结果：每张图谱约检测到900个蛋白质点，共发现27个差异表达蛋白，选择背景清晰、重复性及分辨率较好、蛋白表达差异明显的点进行质谱分析，结合表观分子质量及等电点，初步鉴定