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以三氯乙酸—丙酮沉淀法粗提的棉花总蛋白为材料，比较了丙酮沉淀法、醋酸铵沉淀法纯化棉花总蛋白的效果．结果显示：与三氯乙酸—丙酮沉淀法提取的棉花总蛋白干粉加入裂解液后直接电泳相比较，经丙酮沉淀法和醋酸铵沉淀法处理后的总蛋白杂质干扰少、电泳结果蛋白条带清晰，蛋白含量较高，相比醋酸铵沉淀法丙酮沉淀法效果较好，适合于棉花蛋白质组学研究中纯化总蛋白质．