A组轮状病毒广州地方株VP7基因序列的比较分析

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sudyhard
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目的了解我国轮状病毒G1型广州地方株与标准株及北京G1型地方株VP7基因序列的差异,为我国轮状病毒疫苗的研制提供资料.方法通过逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)获得了轮状病毒广州地方株R97-196 VP7全基因的cDNA片段,将其克隆入T-A克隆质粒pUCm-T中,构建成重组质粒pUCmT-VP7,对克隆的VP7基因进行序列测定.结果该地方株的基因核苷酸全长为1 062 nt,读码框架和以往的研究一致,和北京G1型地方株T73的VP7氨基酸序列具有高度同源性(98%),而与不同血清型标准株间则变异较大(73%~81%),氨基酸序列中存在的一些高变区和保守功能区与已报道的研究结果一致.从进化角度分析,与轮状病毒标准株Wa株,相距较远.结论轮状病毒广州地方株R97-196 VP7基因片段属G1型,轮状病毒VP7基因的变异与地域有一定关系.

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