【摘 要】
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选取江豚基因组中的2个已知单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,通过PCR扩增,将PCR产物按基因频率不同制备成0~50%的11个DNA池(DNA pool),用于变性高
【基金项目】
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国家自然科学基金重点资助项目(30830016);国家自然科学基金资助项目(30670294);教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目(NCET-07-0445);江苏省高校重大基础研究计划(07KJA18016)
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选取江豚基因组中的2个已知单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,通过PCR扩增,将PCR产物按基因频率不同制备成0~50%的11个DNA池(DNA pool),用于变性高效液相色谱(denatu-ring high performance liquid chromatography,DHPLC)和直接测序分析,以探讨DNA池中基因频率的最低要求。结果显示,当稀有等位基因的基因频率不少于5%时可在DHPLC检测过程中明显分辨;而利用DNA池进行直接测序时的基因频率则需达到10%。这提示,为保证DHPLC分析的准确性和可靠性,制备DNA池时等摩尔DNA混合的个体数最好不超过10个。DNA池结合DHPLC技术的高效性与准确性可在大规模的SNPs位点筛选中发挥作用。
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