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目的
通过构建扩张型心肌病患者外周血浆的mRNA差异性表达谱，并对差异表达的mRNA进行功能分析，为阐明扩张型心肌病的发生发展机制提供依据。
方法应用转录组测序技术(RNA-seq)构建扩张型心肌病组(6例)和正常对照组(9例)的mRNA表达文库，获得基因水平的mRNA FPKM值，作为mRNA的表达谱，计算两组样品间差异并获得差异mRNA表达谱，利用差异mRNA进行基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析，进一步研究差异mRNA的功能。随机挑选3个显著上调和3个显著下调的差异表达mRNA，选取10例扩张型心肌病患者和10例健康对照，进行定量即时聚合酶链锁反应验证。
结果共筛选出1 418条差异表达的mRNA，其中上调的有800条，下调的有618条，通过GO和KEGG生物学功能分析，发现差异性表达的mRNA参与到能量代谢、肌肉组织器官发育、细胞离子稳态失衡等生物学过程，显著富集在Wnt信号通路，并进一步筛选出可能与扩张型心肌病有关的目标基因GSK3β和SFRP2。应用定量即时聚合酶链锁反应在扩大样本中进行验证，结果差异均有显著统计学意义(P<0.05或P<0.01)。
结论本研究应用RNA-seq技术获得扩张型心肌病mRNA差异性表达谱，筛选出可能与扩张型心肌病有关的目标基因，为进一步研究扩张型心肌病的发病机制和药物治疗靶点提供依据。