【摘 要】
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运用高通量技术对杂交鳢进行转录本测序和数据分析,经拼接与组装,最终获得52 065条unigenes,长度范围201~12 407 bp,序列平均长度为710 bp。从长度分布、GC含量和基因表达量
【机 构】
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河南科技大学动物科技学院,中国水产科学研究院珠江水产研究所,中国水产科学研究院南海水产研究所,广东省渔业生态环境重点实验室
【基金项目】
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国家科技支撑计划(2012BAD25B04);河南省自然科学基金项目(162300410069);河南省高等学校重点科研项目(16A240002);广东省渔业生态环境重点实验室开放基金(LFE–2016–13)
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运用高通量技术对杂交鳢进行转录本测序和数据分析,经拼接与组装,最终获得52 065条unigenes,长度范围201~12 407 bp,序列平均长度为710 bp。从长度分布、GC含量和基因表达量等方面对unigenes进行评估,数据显示测序质量较好。进一步的数据分析,共鉴定出20 535个CDS,37 324个SNP位点和7 830个微卫星。用6大数据库Swiss–Prot、Nr、Pfam、KEGG、KOG和GO注释杂交鳢转录组unigenes,分别对应有20 955、28 938、19 339、14
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