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目的探讨上海地区丙型肝炎病毒(HCV)1 b亚型慢性感染者的血清HCV非结构基因5A(NS5A)与干扰素(IFN)疗效的关系.方法收集上海地区24例HCV1 b慢性感染者在干扰素治疗前后及随访过程中的血清标本,定量检测治疗前血清HCV RNA,用逆转录-聚合酶链反应方法扩增NS5A的干扰素敏感决定区(ISDR)基因并进行测序和分析.另扩增干扰素应答类型不同的3例患者治疗前后共5株HCV病毒的NS5A全长序列,测序后作种系发生树分析及蛋白二级结构预测.结果治疗前血清HCV RNA的定量结果显示,持续应答组的病毒滴度(平均滴度4.50×104 copies/ml)明显低于复发组和无应答组(平均滴度1.82×107 copies/ml).24例慢性丙型肝炎患者干扰素治疗前血清HCV的ISDR氨基酸序列与抗干扰素的HCV-J株比较,13例为野生型,11例为中间型,无突变型.6例完全应答者3例感染的是野生型株,另3例感染的是中间型病毒株.5株HCV病毒的NS5A全长序列种系发生树显示,3种不同应答类型株在种系发生上分属3个组别,无应答株与抗干扰素的HCV-J株关系相近被归为1组.蛋白质二级结构预测显示,上述病毒株NS5A蛋白在二级结构方面基本相似,仅在2 255～2 289范围内有明显不同,这一区域与PKR结合域部分重叠.结论 HCV NS5A基因的ISDR区不能单独用于预测干扰素疗效,治疗前血清HCV RNA水平结合NS5A区的PKR结合域序列的分析,可能有助于预测干扰素疗效,指导临床用药.