利用表达谱芯片分析水稻籼粳交杂种优势的分子基础

来源 :南京农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:peng88888888
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]本文旨在研究水稻籼粳交杂种优势的分子基础。[方法]利用Affymetrix水稻表达谱芯片分析了强优势水稻籼粳交组合‘申9A/繁31’与母本‘申9A’和父本‘繁31’在幼穗分化初期剑叶组织的基因表达差异,并对差异表达基因进行了基于生物学过程的GO(gene ontology)功能分类和代谢通路分析。[结果]幼穗分化初期杂种与双亲的表型已经产生了明显差异;共有2 258个基因在杂种与亲本之间差异表达(差异倍数≥2或≤0.5),杂种与双亲均显示差异表达的基因有327个,杂种与父本之间的差异表达基因远多于母本。杂种差异表达基因具有多种表达模式,具有正效应基因的增强表达和具有负效应基因的抑制表达对杂种优势均有贡献。差异表达基因主要参与了磷代谢、运输、防卫反应以及碳水化合物代谢等生物学过程,并在碳固定、氨基酸代谢、糖酵解/糖原异生以及磷酸肌醇代谢等多个代谢通路富集。[结论]水稻籼粳交杂种优势存在复杂的分子基础,多种分子机制参与了杂种优势的形成,光合效率和光合产物运输分配效率的提高可能是杂种优势产生的主要原因。 [Objective] The aim of this paper is to study the molecular basis of indica-japonica cross hybrid vigor in rice. [Method] Affymetrix rice cDNA microarray was used to analyze the gene expression of flag leaf tissue in the early stage of spike differentiation between indica and japonica crosses (’Shen 9A / Fan 31’) and female parent ’Shen 9A’ Differences in gene expression and differential gene expression based on biological processes GO (gene ontology) functional classification and metabolic pathways. [Result] The phenotypes of hybrids and parents had a significant difference at the early stage of spike differentiation. A total of 2 258 genes were differentially expressed between the hybrids and their parents (with a multiple of 2 or greater than or equal to 0.5), and both hybrids and parents showed differentially expressed There are 327 genes, and there are far more differentially expressed genes between the hybrid and the male parent than the female parent. Hybrid differential expression of genes with a variety of expression patterns, with positive effect of gene expression and negative expression of genes have inhibitory effects on heterosis contribute. Differentially expressed genes are mainly involved in biological processes such as phosphorus metabolism, transport, defense response and carbohydrate metabolism, and are enriched in a number of metabolic pathways such as carbon fixation, amino acid metabolism, glycolysis / gluconeogenesis and phosphoinositide metabolism . [Conclusion] There existed complicated molecular basis for the hybrid heterosis in indica-japonica hybrid rice. Various molecular mechanisms were involved in the formation of heterosis. The increase of photosynthetic efficiency and photosynthetic transport efficiency could be the main reason for heterosis.
其他文献
该文从挂篮荷载计算、施工流程、支座及临时固结施工、挂篮安装及试验、合拢段施工、模板制作安装、钢筋安装、混凝土的浇筑及养生、测量监控等方面人手,介绍了S226海滨大桥
该文从挂篮荷载计算、施工流程、支座及临时固结施工、挂篮安装及试验、合拢段施工、模板制作安装、钢筋安装、混凝土的浇筑及养生、测量监控等方面人手,介绍了S226海滨大桥
期刊
由湖北荆楚种业股份有限公司培育,杂交棉品种,商品名楚杂180F1。2004年通过湖北发代号-84省农作物品种审定委员会审定。该品种株型较紧凑,植株高大,塔型。茎杆较硬,有稀茸毛,
期刊
该文从挂篮荷载计算、施工流程、支座及临时固结施工、挂篮安装及试验、合拢段施工、模板制作安装、钢筋安装、混凝土的浇筑及养生、测量监控等方面人手,介绍了S226海滨大桥
期刊
提高凝汽器的冷凝效率是保证汽轮机发电负荷和提高发电热效率的重要途径。本文介绍提高循环冷却水的水质和优化冷凝系统的经验。1循环冷却水质预处理1.1预处理的目的受石灰岩
农业经济一直是我国经济发展的重要部分,对没有其他发展特色,农业人口占多数的乡镇来说尤为如此.本文以开江县为例,通过对其农业机械化发展现状和存在问题的分析,进农业机械
摘 要 近年来,我国越来越重视节水型的农业灌溉,逐渐扩宽了农业灌溉面积,并借此提升了灌溉的经济效益。目前,灌溉渠道的材料大都变成了混凝土,以此用来防渗,减低渠道的渗漏概率,提升水资源重复利用率。基于此,主要探讨分析了渠道防渗砼的设计与施工方法。  关键词 渠道防渗砼;设计施工;施工方法  中图分类号:TV543 文献标志码:B 文章编号:1673-890X(2015)18--02  渠道是一种农业
该文从挂篮荷载计算、施工流程、支座及临时固结施工、挂篮安装及试验、合拢段施工、模板制作安装、钢筋安装、混凝土的浇筑及养生、测量监控等方面人手,介绍了S226海滨大桥
该文从挂篮荷载计算、施工流程、支座及临时固结施工、挂篮安装及试验、合拢段施工、模板制作安装、钢筋安装、混凝土的浇筑及养生、测量监控等方面人手,介绍了S226海滨大桥
期刊
数学是一种文化,数学教育是数学文化的教育,数学教学应承担向学生传递数学文化的重要职责.这就要求我们不仅要注重对学生数学知识的传递,还要重视数学文化内涵的渗透,更需要