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相关序列多态性（SRAP）是近年来发展起来的一种新型分子标记系统，具有简便、稳定、中等产率、高共显性、易于测序等优点。它利用独特的引物设计对ORFs进行扩增，正、反引物分别与外显子和内含子（或启动子）区域配对，因不同物种、不同个体的内含子、启动子与间隔区长度不等而产生多态性。SRAP-PF2R扩增程序采用复性变温法，前5个循环复性温度为35℃，后35个循环为50℃。目前SRAP已在植物图谱构建、遗传多样性评价、基因定位和比较基因组学等方面成功应用。