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在电子自旋共振仪中，由于所采集的信号受脉冲和连续变化的扫场电流的干扰，造成测量数据失真，从而导致显示不稳定。通过硬件和软件滤波的方法可以消除干扰。本文研究了一种基于软件的混合滤波算法，该算法是一种极值和均值相结合的混合滤波算法。实验表明，这种混合滤波方法比通常的中值滤波、均值滤波具有更好的抗干扰能力，能够提高数据的准确度。采用混合滤波算法后，电流测量值的误差不大于±0.4mA，达到了设计要求。