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现行群体间遗传距离的度量方法都以等位基因频率的计算为依据，这些方法的缺点之一是在位点不多，多态笥不高时要求群体有较大的取样个体数目，另外，这些方法所建造的树素图不能反映群体是由混血引起还是由长期进化引起这一问题，针对这些问题，本文提出了以个体间蛋白质多位点基因型比较为基础的群体间遗传距离和群体内基因杂合度的度量方法，以十个主要中国黄牛群体的遗传关系分析为例，比较圆满的解决了上面几个问题。