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高等学校专业结构与经济产业结构之间有着密切的联系。目前安徽省地方高等学校的专业设置还存在着政府权力过分膨胀、高校专业设置自主权日渐式微、社会参与度底、与市场贴近度不够等问题。在此基础上,提出学科专业的设置应合理配置政府权力,逐步建立省级政府统筹规划机制;进一步贯彻和落实高等学校专业设置自主权,逐步形成高校自我发展自我约束机制;要以市场为导向,形成竞争机制;要面向社会,逐步形成社会参与机制,使学科专业设置权力的运行达到一种动态的平衡与制约。