旗帜就是方向，旗帜就是形象，旗帜问题至关紧要。江泽民同志在16大报告中明确提出，“三个代表” 重要思想是我们党必须长期坚持的指导思想。标志着我们党在马列主义、毛泽东思想、邓小平理论之后，又把“三个代表”重要思想写到自己的旗帜上。
　　把“三个代表”重要思想写到党的理论旗帜上，是势所必然。“三个代表”重要思想开创了马克思主义理论的新境界，把毛泽东思想、邓小平理论推进到新阶段，使我们对什么是社会主义、怎样建设社会主义和建设一个什么样的党、怎样建设党的认识达到了新水平，已经在党的理论上和实践中发挥了巨大的指导作用，成为全党全国人民的行动指南。所以，把“三个代表”重要思想写到党的旗帜上，同马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论一起作为党的指导思想，是理所当然，顺理成章。
　　把“三个代表”重要思想确立为党的指导思想，意义重大。中国共产党是非常重视理论指导的党。在革命、建设和改革的不同历史阶段，党都把马克思列宁主义同我国具体实际相结合，形成新的理论成果，提供新的理论武器。在新民主主义革命时期，形成了马克思主义中国化的第一个理论成果——毛泽东思想。在改革开放时期，形成了马克思主义中国化的第二个理论成果——邓小平理论。进入新的世纪，我们面临新的形势、新的情况，概括起来就是四个巨大变化：世界发生了重大变化、中国发生了重大变化、人民群众工作生活发生了重大变化、党的队伍发生了重大变化。要把中国的改革开放继续推进，必须对新的问题作出理论上新的概括和回答。正是在这样的时代背景下，江泽民同志提出了“三个代表”重要思想，为新世纪的中国发展、为新世纪的中国共产党的建设指明了方向。它是马克思主义中国化的新的理论成果，是我们各项工作的行动指南。
　　高举党的理论旗帜，贯彻“三个代表”重要思想，关键在坚持与时俱进，核心在坚持党的先进性，本质在坚持执政为民。
　　与时俱进，就是要不断开拓马克思主义理论发展的新境界。江泽民同志强调要坚持两个“坚定不移、不能含糊”：一是必须坚持马克思主义的立场、观点和方法，坚持马克思主义的基本原理。这一点，要坚定不移，不能含糊。二是一定要贯彻解放思想、实事求是的思想路线，坚持勇于追求真理和探索真理的革命精神。这一点，也要坚定不移，不能含糊。他强调，“这两个‘坚定不移，不能含糊’，始终是检验我们是不是真正的马克思主义者的试金石。”我们一定要适应实践的发展，以实践来检验一切， 自觉地把思想认识从那些不合时宜的观念、做法和体制的束缚中解放出来，从对马克思主义的错误的和教条式的理解中解放出来，从主观主义和形而上学的桎梏中解放出来，善于在解放思想中统一思想，用发展着的马克思主义指导新的实践，把中国特色社会主义事业不断推向前进。