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生物或非生物胁迫影响药用植物的产量和质量。药用植物抗逆分子遗传机制的研究有助于抗逆基因的挖掘及高抗优质新品种的选育。本文概述生物胁迫下植物的先天性免疫反应(非寄主抗性、基础抗性、小种非特异性抗性以及特异性免疫反应)和系统获得性抗性,以及非生物胁迫(如高温、低温、干旱、盐碱)植物耐受性的分子机制,并对bZIP类、MYB类、AP2/ERF类、WRKY类以及NAC类转录因子对抗逆基因调控作用进行分析,提出通过解析药用植物的遗传信息,挖掘相关抗逆基因,可以加快药用植物抗逆品种的选育,进而有效提高药材的品质和产量。