分子动力学研究亚铁血红素激活蛋白转录激活机理

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【摘要】

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以3种亚铁血红素激活蛋白（Heme activator protein，HAP）-DNA复合物（野生型HAP1-wt，Set63／Arg63突变HAP1—18和Ser63／Gly63突变HAP1-PC7）为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进

【作者】

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赵熹黄旭日孙家锺

【机构】

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吉林大学理论化学研究所

【出处】

：

高等学校化学学报

【发表日期】

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2008年4期

【关键词】

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分子动力学转录激活柔性亚铁血红素激活蛋白 Molecular dynamics Transcriptional activation Flexibil

【基金项目】

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国家自然科学基金（批准号：20103003）、教育部骨干教师基金和吉林省杰出青年基金资助.

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以3种亚铁血红素激活蛋白（Heme activator protein，HAP）-DNA复合物（野生型HAP1-wt，Set63／Arg63突变HAP1—18和Ser63／Gly63突变HAP1-PC7）为对象对亚铁血红素激活蛋白的转录激活机理进行了分子动力学研究．对3个复合物分子动力学轨迹的比较性分析显示，涉及到上游活化序列（Upstream activation sequences，UAS）识别的蛋白质-DNA相互作用分布与实验观测到的3种蛋白转录活性一致．进一步对3个复合物进行柔性分析显示，3个DN

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