【摘 要】
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研究目的:基于转录组数据开发具有扩增率高和跨物种转移性的基因组编码区内的SSR(genic-SSR)标记,为梨属植物的分子系统发育关系和遗传多样性相关研究提供新的方法。创新要点
【机 构】
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State Agricultural Ministry Key Laboratory of Horticultural Plant Growth,Development&Quality Improve
【出 处】
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Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biote
【基金项目】
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supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31201592);the Modern Agro-industry Technology Research System(No.nycytx-29-14);the Doctoral Program of Higher Education(No.2011010111
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研究目的:基于转录组数据开发具有扩增率高和跨物种转移性的基因组编码区内的SSR(genic-SSR)标记,为梨属植物的分子系统发育关系和遗传多样性相关研究提供新的方法。创新要点:首次利用梨属植物的转录组测序(RNA-seq)数据结合M-13荧光尾巴高效率地开发了104个genic-SSR标记,并成功将其应用于梨属植物的系统发育关系研究中。研究方法:应用生物信息学软件从转录组测序数据中搜索SSR位点和设计相应引物,结合高效的M-13荧光尾巴的方法筛选多态性高的SSR标记。重要结论:转录组数据能够为梨属植物分子系统发育关系和遗传多样性研究提供新的SSR标记来源。
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