【摘 要】
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目的:寻找致心律失常性右室心肌病(ARVC)发病关键基因.方法:从GEO数据库获得人类ARVC现有信息芯片,筛选出ARVC心肌和正常心肌间差异基因.通过David数据库进行基因本体论(GO)
【机 构】
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安徽医科大学第一附属医院心血管内科 合肥,230022;安徽医科大学第一临床医学院;安徽医科大学基础医学院
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目的:寻找致心律失常性右室心肌病(ARVC)发病关键基因.方法:从GEO数据库获得人类ARVC现有信息芯片,筛选出ARVC心肌和正常心肌间差异基因.通过David数据库进行基因本体论(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,利用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用(PPI)网络.结果:共鉴定出101个差异基因,包括40个上调基因和61个下调基因.GO分析显示,P＜0.01且基因数＞10的生物过程(BP)包括炎症反应和信号转导,细胞组分(CC)包括细胞膜、细胞外空间和细胞外区域.KEGG分析显示,P＜0.01的通路为肿瘤坏死因子(TNF)信号通路.经过PPI分析筛选得出10个关键基因:白细胞介素6(IL-6)、CCL2、AIF1、CD 14、CCR1、FCER1G、FPR1、PTGS2、S100A9和S100A8.结论:ARVC的发生发展可能与炎症机制密切相关,可作为潜在的治疗靶点为ARVC进一步研究提供依据.
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