【摘 要】
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用RT-PCR法,以口蹄疫病毒(FMDV)WH/99株牛舌水泡皮为材料,提取RNA及扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy载体连接并转化JM109菌株,再经重组质粒电泳、PCR和EcoRⅠ酶切鉴定;用DNAs
【基金项目】
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国家重点基础研究发展计划(973计划);
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用RT-PCR法,以口蹄疫病毒(FMDV)WH/99株牛舌水泡皮为材料,提取RNA及扩增目的cDNA,然后与pGEM-T Easy载体连接并转化JM109菌株,再经重组质粒电泳、PCR和EcoRⅠ酶切鉴定;用DNAstar软件比较功能未知区的序列差异,以RNAdraw软件分析它们的二级结构.结果表明,7株FMDV的功能未知区序列长度介于207-256个核苷酸;序列分析表明,WH/99与AsiaⅠ 63/72、A24/Cruzeiro、TWTY/97和TWCP/97的序列差异最大,预示此区段可能与病毒感染嗜性有关;二级结构分析表明,A24/Cruzeiro、Asia Ⅰ 63/72和TWCP/97均有5个结构域,WH/99和TWTY/97具有6个结构域.TWTY/97和TWCP/97二级结构的差异可能是TWTY/97功能未知区第20位插入的"C"所致,而O1K/66和O1Campos仅有3个结构域.2株猪O型FMDV功能未知区5′端存在着连续的核苷酸缺失现象,最多达52个,唯有3株牛O型FMDV(O1K/66、O1Campos和WH/99)在上述位置无任何缺失.
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