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矿区内出露地层主要为中泥盆统北塔山组第二亚组，为一套海相、海陆交互相的中基性、中酸性火山岩一火山碎屑沉积岩建造。矿区构造较为复杂，为矿液的运移及铜、钼矿质的沉淀、富集提供了良好的空间条件。Sm—Nd等时线年龄测定显示矿床形成于早二叠世，蚀变岩的Rb—Sr全岩年龄测定结果也反映了成矿和该时期发生的热事件有关。索尔库都克铜（钼）矿床成因应该归属于次火山热液层控型铜（钼）矿床。