【摘 要】
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目的探讨差异表达miRNAs与甲状腺癌患者预后的关系。方法从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载甲状腺癌及甲状腺癌旁组织的miRNAs测序数据和临床信息。采用R程序语言包筛选差异
【机 构】
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锦州医科大学解放军202医院研究生培养基地,解放军202医院检验科
【基金项目】
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辽宁省科学技术计划项目(201602749)
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目的探讨差异表达miRNAs与甲状腺癌患者预后的关系。方法从肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库下载甲状腺癌及甲状腺癌旁组织的miRNAs测序数据和临床信息。采用R程序语言包筛选差异表达的miRNAs。应用Kaplan-Meier(log-rank检验)生存曲线进行生存分析,比较与总体生存率相关的miRNAs与临床参数的关系。利用靶基因分析软件对与总体生存率相关miRNAs的靶基因进行预测,并进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果筛选出差异表达miRNAs共计91个,其中上调miRNAs 86个,下调miRNAs 5个。miRNA-509-3、miRNA-196a-2和miRNA-767与总体生存率呈显著相关(P<0.05)。miRNA-509-3和miRNA-196a-2与临床分期和甲状腺癌类型显著相关(P<0.05)。3种miRNAs的靶基因主要参与细胞黏附、凋亡、细胞周期等生物学过程和与肿瘤相关的代谢通路。结论 miRNA-509-3、miRNA-196a-2和miRNA-767可能在甲状腺癌的发生发展中发挥作用,通过对3种miRNAs的靶基因预测分析,为甲状腺癌发病机制的进一步研究提供基础。
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