木薯sRNA测序分析及其开花相关microRNA的挖掘

来源 :热带作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：street_litter

【摘要】

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为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控。本研究以木薯品种“华南八号”花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关mi

【作者】

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丛汉卿龙娅丽王荣香孙化鹏乔飞

【机构】

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中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部华南作物基因资源与种质创制重点实验室,中国热带农业科学院科技信息研究所

【出处】

：

热带作物学报

【发表日期】

：

2018年12期

【关键词】

：

木薯 sRNA microRNA 开花表达特性

【基金项目】

：

中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(No.1630032014036,No.1630032018009)

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为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控。本研究以木薯品种“华南八号”花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关microRNAs进行表达特性分析。从花序和幼叶测序结果中分别获得12092109条和11499655条sRNA序列。花序中筛选出139条已知microRNAs和253条新预测microRNA,分别预测得到992和3736条靶基因;幼叶中筛选出134条已知microRNA和191条新预测microRNAs,分别预测得到979

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