基于生物信息学途径筛选缺血性脑卒中关键基因及药物预测

来源 :中山大学学报:医学科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zphym
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【目的】筛选缺血性脑卒中的关键基因及重要信号通路,预测可能对脑卒中有用的药物。【方法】从GEO数据库下载GSE98319基因芯片数据,该数据包含了假手术组、大脑中动脉梗塞组(MCAO)小鼠的基因芯片检测结果。用R语言的Limma包对数据进行差异表达分析,P<0.05且|log2FC|>0.6的基因为差异表达基因。借助STRING网站构建差异表达基因的蛋白质相互作用网络(PPIN)后由Cytoscape软件进行核心子网络筛选及可视化输出。筛选出核心基因后用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证
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