MreB蛋白与actin蛋白的同源建模和进化关系研究

来源 :文山学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：striving123

【摘要】

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为认识原核MreB蛋白和真核actin蛋白结构相关性和进化关系，应用SWISS-MEDOL、PROCHECK和PyMOL等生物信息学软件分别对19种MreB蛋白和16种actin蛋白进行了同源建模、质量评估、

【作者】

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沈清清刘芳赵芳张玉洁

【机构】

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文山学院环境与资源学院,文山学院化学与工程学院

【出处】

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文山学院学报

【发表日期】

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2015年3期

【关键词】

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蛋白原核真核同源建模进化 protein prokaryote eukaryote homology modeling evolution

【基金项目】

：

基金项目：文山学院科学研究基金项目“真核生物与原核生物细胞骨架蛋白的同源建模对比分析及系统进化关系研究”（11WSY01）.

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为认识原核MreB蛋白和真核actin蛋白结构相关性和进化关系，应用SWISS-MEDOL、PROCHECK和PyMOL等生物信息学软件分别对19种MreB蛋白和16种actin蛋白进行了同源建模、质量评估、蛋白叠合比对分析；以MreB和actin为分子指标利用MEGA6构建生物进化树分析其进化关系。研究结果表明同源建模获得的蛋白模型基本符合立体化学规则，有较高的合理性与可靠性，其中大部分属于高质量模型（落于最适区的氨基酸残基数＆gt;90%）；蛋白叠合比对结果表明MreB和actin蛋白虽为同源蛋白，氨

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