c血清型变形链球菌低毒力株特异DNA片段的生物信息学分析

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目的:发现c血清型变形链球菌低毒力株特异的新基因或已知基因的新功能,推测、鉴定基因所编码蛋白质的功能.方法:对筛选得到的26 个变形链球菌低毒力株特异的DNA片段进行序列测定,利用BLAST 2.2.6程序进行核苷酸和含6相位阅读框架编码氨基酸的相似性检索.结果:变形链球菌低毒力株特异的DNA片段大小在113~776 bp之间,平均G+C含量为38.27%,其中有8 个片段为新的基因片段,在GenBank中登记.结论:发现了8 个新的基因片段以及低毒力株特异的DNA片段的主要功能,为下一步的基因功能研究奠定基础.
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