【摘 要】
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目的建立敲除基因组中PDE10A基因的CRISPR/Cas9系统。方法设计3个长20bp的sgRNA,分别靶向PDE10A的exon 6、exon 7和exon 11。化学合成sgRNA寡核苷酸序列,并克隆进PX330质粒中
【机 构】
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中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(31222031);中央高校基本科研业务费专项资金(2012S05);协和青年科研基会(2012J09);新世纪优秀人才支持计划(NCET-12-0071)
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目的建立敲除基因组中PDE10A基因的CRISPR/Cas9系统。方法设计3个长20bp的sgRNA,分别靶向PDE10A的exon 6、exon 7和exon 11。化学合成sgRNA寡核苷酸序列,并克隆进PX330质粒中。将克隆正确的质粒PX330-sgRNA转染至HEK293T细胞中,提取基因组DNA并对敲除位点附近的DNA片段进行PCR扩增,再通过SURVEYOR分析和一代测序对敲除效率进行检测。最后采用有限稀释法挑选稳定敲除PDE10A的HEK 293T细胞株。结果目的sgRNA寡核苷酸双链成功插入PX330质粒中且序列正确;靶向Exon 7的sgRNA可成功敲除PDE10A,且敲除效率高达31.4%;稳定敲除PDE10A的细胞株筛选成功,可导致2 bp缺失。结论PDE10A基因CRISPR/Cas9敲除系统构建成功。
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