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[目的]分析江西省2005～2006年分离的甲1亚型流感病毒株与疫苗推荐株HA1区的差异，以了解江西省流感病毒变异情况及WHO推荐疫苗株对人体的保护作用。[方法]采集监测医院和疑似流感疫情的流感样病例鼻咽拭子标本进行流感病毒分离，对分离到的甲1亚型流感病毒进行核酸的提取，采用逆转录-聚合酶链反应（RT—PCR）扩增病毒基因后进行核苷酸序列测定，用DNAStar5．0、BioEdit（Version5．0）、Mage生物软件对测序结果进行分析处理，并与WHO推荐疫苗株进行比对。[结果]20株甲1亚型流感病毒