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为更快、更好地传播微生物学与感染病学领域的研究发展和成果,提高本刊刊登的论文质量,提升作者论文的撰写水平,《微生物与感染》编委会决定每年举行优秀论文年度评选活动。从本刊当年刊登的文章中选取优秀论文予以表彰,设一等奖（奖金3 000元）、二等奖（奖金1 000元）,所有奖金由复旦大学上海医学院“一健康基金”提供。