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经济新常态背景下，区域经济发展的主要动力在于不断提高区域科技产出和科技成果的应用能力，从而提高区域技术创新活动的效率和效果，进而推动区域经济的升级发展。现有的研究多侧重于其中的一个视角进行研究，无法准确反映区域科技创新能力的差异，也无法更加精确地评估创新能力对区域产业升级的影响。因此，开发一个综合评价体系来评估区域创新与创新转化能力具有重要的理论和现实意义。在此背景下，本文建立了从科技投入产出效率到技术成果转让效率的两阶段DEA模型，基于2000—2013年高等学校科技统计资料整理的数据，对全国26省市的