【摘 要】
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以陆地棉(Gossypium hirsutum) TM-1为材料,利用同源克隆技术从棉花中分离出SNC2基因,以actin基因为内参,采用半定量RT-PCR分析该基因在棉花组织中的表达,并采用实时定量RT-P
【机 构】
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新疆师范大学生命科学学院,乌鲁木齐,830054;新疆农业科学院核技术生物技术研究所,新疆农作物生物技术重点实验室,新疆农业科学院棉花分子机理与分子育种实验室,乌鲁木齐,830091
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以陆地棉(Gossypium hirsutum) TM-1为材料,利用同源克隆技术从棉花中分离出SNC2基因,以actin基因为内参,采用半定量RT-PCR分析该基因在棉花组织中的表达,并采用实时定量RT-PCR分析不同棉花品种经大丽轮枝菌侵染后,SNC2基因在不同时段、不同组织的表达水平.研究分析发现该基因CDS序列长度为1 308 bp,编码435个氨基酸,蛋白的等电点(pI)为6.98,理论分子量为46.93 kD,命名为SNC2,GenBank登录号为AOO35322.1,SNC2基因编码多肽链中包含信号肽和跨膜结构域,且亚细胞定位于质膜,编码受体类蛋白.组织表达分析显示SNC2基因在根、侧根、茎、叶和花中均有表达,茎中的表达量较高,而在苞片组织中基本不表达.该基因在接菌后的感病品种军棉1号的根和耐病品种中棉49号的茎中呈现不断上升的趋势,而在两个棉花品种的其他组织中呈现出“升-降-升”的趋势,且在不同抗性的棉花品种中的表达存在差异,暗示SNC2基因可能在不同抗性品种抵御生物胁迫过程中扮演重要角色,研究结果为进一步研究SNC2基因的功能及应用该基因提供帮助.
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