一种快速检测单增李斯特菌的双重PCR方法

来源 :中国保健营养 | 被引量 : 0次 | 上传用户:genye
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  【摘 要】探讨检测新鲜海螺样品中单增李斯特菌的双重PCR快速检测方法。基于单增李斯特菌hlyA基因和李斯特菌属的16sRNA基因分别合成两对引物,对影响PCR的主要因素进行优化,最终确定同时检测单增李斯特菌两个特异性基因的双重PCR最佳反应体系及条件,该方法对于纯培养物的最低检出限为102CFU/mL,模拟污染海螺样品的检测限为8CFU/g。
  【关键词】单增李斯特菌;双重PCR;海螺样品
  【中图分类号】R197 【文献标识码】A 【文章编号】1004-7484(2019)01-0225-02
  本工作将单增李斯特菌最重要的毒力因子-编码溶血素的hlyA基因,与李斯特菌属16sRNA基因同时作为单增李斯特菌的检测指标,将双重PCR方法与选择性增菌法相结合,旨在建立一种快速灵敏检测单增李斯特菌的双重PCR方法。
  1 材料与方法
  1.1 材料
  1.1.1 菌种
  单增李斯特菌标准株由省疾病预防控制中心提供;大肠杆菌(Escherichia coil)、沙门氏菌(Salmonella)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、产气杆菌(Aerobacter aerogenes)和伤寒杆菌(Salmonella typhi)为本实验室保存菌株。
  1.1.2 试剂
  李斯特氏菌显色培养基、单增李斯特菌成套生化鉴定管、胰酪胨大豆酵母浸膏琼脂(TSA-YE)、李氏增菌肉汤LB1、萘啶酮酸、吖啶黄素 青岛高科园海博生物有限公司;细菌基因组DNA提取试剂盒、DNA Marker、溶菌酶、蛋白酶K、RNaseA以及PCR相关试剂 北京天根生化有限公司。
  1.1.3 引物序列
  根据文献[1]以单增李斯特菌hlyA基因和李斯特菌属的16sRNA基因作为靶基因分别合成两对特异性引物,所用引物序列见表一,引物由北京六合华大基因科技股份有限公司合成。
  1.1.4 仪器
  VersaDoc凝胶成像仪 美国伯乐;PCR扩增仪 美国伯乐;JM-250电泳仪 大连捷迈科贸有限公司;D-37520高速冷冻离心机 德国Thermo公司。
  1.2 方法
  1.2.1 细菌的活化培养
  取-80℃、25%甘油冻存的菌种,复苏培养后,分别划线于细菌培养基上,37℃培养24h,连续活化两次,将单菌落接种于普通肉汤培养基中,37℃振荡培养18h。
  1.2.2 细菌基因组DNA的制备
  取1ml菌液按照细菌基因组DNA提取试剂盒说明书步骤进行DNA提取,并溶于100 μL TE缓冲液中,于-20℃下保存。
  1.2.3 双重PCR的体系建立及优化
  双重PCR扩增体系:10×Buffer(Mg2+)5?L 、dNTPs(2.5mmol/L)4?L、两对10mmol/L的上下游引物各1?L、 DNA模板5?L,Taq酶(2.5U/?L)0.8?L ,用ddH2O補足至50?L。
  双重PCR反应条件:采用热启动。95℃预变性3min ,94℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸80s,共30个循环,72℃终延伸10min。
  在上述反应体系和条件下,对退火温度进行优化,分别设定退火温度为:55℃、55.8℃、57.1℃、58.9℃、61.4℃、63.3℃,通过对电泳结果的分析,最终确定最佳退火温度。
  1.2.4 双重PCR特异性及灵敏度检测
  特异性检测:分别提取单增李斯特标准株、大肠杆菌、沙门氏菌、金黄色葡萄球菌、枯草芽孢杆菌、产气杆菌及伤寒杆菌模板DNA,在最佳双重PCR体系及条件下扩增,检测引物特异性。
  灵敏度检测:将过夜培养的单增李斯特菌菌液用无菌的生理盐水10倍梯度稀释,使目标菌浓度依次为:106CFU/mL 、105CFU/mL 、104CFU/mL 、103CFU/mL 、102CFU/mL 、10CFU/mL。分别提取不同浓度菌液的模板DNA,在最佳双重PCR体系及条件下扩增,确定双重PCR的检测灵敏度。
  1.2.5 人工污染海螺样品的制备及检出限检测
  无菌操作取一只海螺的软组织及体液(阴性)共12.5g,加入李氏增菌肉汤LB1(含抑菌剂)中,充分摇匀制成均质液,用无菌生理盐水10倍梯度稀释初始浓度为106CFU/mL的单增李斯特菌菌液,取1mL不同稀释度的菌液分别加入待检试样的均质液中,30℃震荡培养24h,分别取1mL增菌液按照方法1.2.2提取模板DNA,进行双重PCR检测,确定人工污染海螺样品的最低检出限。
  2 结果与分析
  2.1 不同退火温度下双重PCR扩增结果
  对双重PCR的退火温度进行优化(图一),结果可见两条带在一定温度范围内均能有效扩增, 702bp 条带在相同退火温度下的扩增效果均较938bp条带明显,其中在退火温度为55.8℃和58.9℃时,两特异条带同时扩增清晰,考虑到降低退火温度可以提高扩增效率,最终选定55.8℃为最佳退火温度,从而确定双重PCR最佳反应条件。
  2.2 特异性及灵敏度检测结果
  在双重PCR最佳反应体系及条件下,应用引物1及引物2对不同细菌的模板DNA进行双重PCR扩增。特异性检测结果(图二)显示:只有单增李斯特菌标准株可扩增出938bp和702bp二条带,而其他6株致病菌除引物二聚体外均未出现任何扩增条带,该双重PCR特异性良好。
  将初始浓度分别为106CFU/mL、105CFU/mL、104CFU/mL、103CFU/mL、102CFU/mL、10CFU/mL的单增李斯特菌菌液的DNA作为双重PCR反应模板,确定双重PCR检测纯菌液的灵敏度,由图三可知:两特异条带同时检出的最低菌液浓度为102CFU/mL,其灵敏度能够满足样品选择性增菌后的检测要求。
  2.3人工污染海螺样品的检出限
  单增李斯特菌菌液初始浓度为106CFU/mL,取不同稀释浓度菌液1mL,污染12.5g海螺阴性样品,30℃ LB1震荡培养24h,分别提取增菌液DNA进行双重PCR检测,检测结果如图四所示,当浓度为102CFU/mL的菌液污染海螺样模板品仍可检出,经计算,此双重PCR检测模拟污染海螺样品检出限为8CFU/g。
  3 结论
  本工作所采用的检测水产品中单增李斯特菌的双重PCR快速方法,菌液灵敏度为102CFU/mL,模拟污染海螺样品检出限为8CFU/g,全程检测时间包括增菌时间在内仅27小时,与国标方法相比省时省力且经济,可快速检测出实际样品中的阳性样品与疑似阳性样品,可作为海螺样品中单增李斯特菌的初步鉴定方法。
  参考文献
  [1]王海艳,刘中学,等.食品中单增李斯特菌PCR检测方法所用引物的特异性比较[J].检验检疫科学,2007(6):3-8.(J)
其他文献
【摘 要】目的:探讨羊水产前诊断在地中海贫血(以下简称“地贫”)胎儿中的应用,通过羊水产前诊断,检出中、重型地贫儿,知情选择终止妊娠,降低出生缺陷。方法:采用GaP-PCR方法诊断中国人常见的东南亚型(--SEA)基因缺失、-α3.7基因缺失和 -α4.2基因缺失;采用反向斑點杂交法(PCR-RDB)检测常见的αT珠蛋白基因αCS、αQS 和αWS 3种点突变及17种β-地贫基因突变类型,对100
期刊
由于初产妇对分娩相关方面知识的匮乏、分娩时的疼痛刺激及其对婴儿安全的担忧,均会导致其过度焦虑和恐惧,而这些不健康的心理状况均会严重影响产程的进展和母婴的安全[1-2]。随着现代医学模式的不断转变以及患者及家属对护理服务要求的不断提高,产妇的心理护理日趋重视,如何贯彻实施“以人为本”的优质护理理念是该领域研究的热点问题之一,而在初产妇分娩过程中采用背景音乐可以很好的缓解其过度焦虑和恐惧心理,为此,我
期刊
【摘 要】量子力学是研究物质世界微观粒子运动规律的物理学分支,量子力学不仅是相对物理学的基础理论之一,而且在化学、医学等学科和许多近代技术中得到广泛应用。量子的特点波粒二象性。量子纠缠是一种量子力学的现象,是现代物理学界最热门的话题,目前量子医学多应用于各种仪器的研究上如磁共振、半导体激光等;而我们把量子特性及量子纠缠应用于中医领域,可能会找到治疗疾病更快的中医疗法,本文将初步探讨将量子力学规律应
期刊
【摘 要】目的:通过住院制护士的建立实施 培养护理复合型人才 使年轻护士得到锻炼。方法:介绍住院总制度建立及实施的方法。结果:年轻护士迅速得到提高和锻炼。结论:通过住院制的建立及实施,使年轻护士得到很快的提高,值得更多医院实行和推广。  【关键词】住院总护士;建立;实施;体会  【中图分类号】R197 【文献标识码】A 【文章编号】1004-7484(2019)01-0238-02  住院总医师早
期刊
【摘 要】目的 :通过可摘戴临时贴面美学修复前牙的临床观察,评价可摘戴临时贴面使用后的临床效果。方法:选择牙体制备多、切端缺损等患者,制作可摘戴临时贴面,粘戴最终修复体前的临床效果观察。结果:复诊时可摘戴临时贴面完整存在,牙龈无明显炎症,牙体预备面及可摘戴临时贴面无明显菌斑附着。结论:可摘戴临时贴面可使患者直视自己修复后的形态,患者修复区组织保持健康,口内无异味,易被患者和医生接受。  【关键词】
期刊
【摘 要】目的:探讨团队健康管理在初诊高血压病疗养员中的应用。方法:选择2015年1月-2016年1月来我院疗养的疗养员出诊高血压的患者120名,随机分为对照组和健康管理组每组各60例,对照组进行常规健康教育和护理,健康教育组健康管理小组成员进行系统的疾病管理。结果:健康管理组治疗效果明显,患者血压控制水平及自我管理能力,依从性都明显高于对照组(P<0.05). 结论:对初步诊断高血压病的患者通过
期刊
【摘 要】目的:探讨肝胆科手术病人术前留置胃管的最佳时机。方法:于2017年1月~2017年6月,选取100例肝胆科手术患者作为研究对象,随机分为两组,每组各50例。对照组采用常规方法,病人在清醒状态下术晨在病房留置胃管;观察组于术前在手术室静脉全麻后在喉镜的引导下留置胃管。比较两组患者留置胃管产生的不良反应、并发症及一次性留置胃管的成功率。结果:与对照组相比,观察组的在留置胃管产生的不良反应、并
期刊
【摘 要】目的:分析某结核病定点医院2013-2017年结核病出院患者病案首页信息,总结疾病分布规律,为进一步的结核病防治策略提供依据。方法:运用描述性流行病学统计方法对结核病出院患者性别、年龄、疾病发病部位等信息进行统计分析。结果:结核病患者男性多于女性,男女比1.52。0-15岁占比较少,21-25岁、41-80岁两年龄段占比较大(总计73.34%)。结核病中肺结核占比较大(75.42%)。结
期刊
【摘 要】目的:分析2015—2018年北京市密云区太师屯镇其他感染性腹泻病例的流行病学特征,为社区其他感染性腹泻的防控提供参考依据。方法:对北京市密云区太师屯镇2015—2018年“中国疾病预防控制信息系统”上报的其他感染性腹泻的诊断病例信息进行流行病学分析。结果:2015—2018年北京市密云区太师屯镇共有其他感染性腹泻病例646例,年平均发病率为519.59/10万,发病呈逐年下降的趋势,发
期刊
【摘 要】目的:分析某地区的食用碘盐质量检测结果并对碘缺乏病的防治对策进行探究。方法:采用抽样法抽取某地区2014年至2017年的共1200户居民进行食用碘盐检测,检测方法为直接滴定法,对1200户居民的2014年至2017年的非碘盐、合格碘盐及不合格碘盐等情况进行统计分析,并对其2014年至2017年的碘盐覆盖情况进行统计分析。结果:通过检测发现,1200户居民的1200份盐样本中,非碘盐有9份
期刊