土地储备治理体系的优化是加强土地资产管理、优化土地资产配置、增强土地市场有效供给的重要基础。随着近年来我国城镇化进程的加快，土地储备在机构职能权限、资金保障、系统性风险等方面存在不足，其原因之一在于土地储备治理体系不够完善。以制度变迁为视域，对土地储备体系进行法理考察和实证分析，探讨土地储备治理体系的优化逻辑，将为高效配置土地资源、促进经济社会发展提供新动能、新模式和新路径。本研究以重庆为例，从土地储备治理体系的现状出发，对近年来土地储备现状、优势和不足展开实证分析，分析表明，从优势上看，重庆土地储备的融资渠道得到拓宽，有力支持了当地经济建设；土地储备监管更为便捷，实现了土地储备计划、管理、开发和出让等环节的分离；土地储备财务风险得到一定控制，通过市场化解财务风险，由不同类型的国有独资企业在土地储备工作中既代表政府执行土地储备计划又作为市场主体考虑盈利，不同类型的国有独资企业采用市场资本运作的方式使土地储备的财务风险得到控制；土地储备促进了重大项目工程建设的推进，土地储备中心也加强了一级市场调控、建立了储备土地信息库、科学编制了储备计划、加快推进了前期开发等工作。缺陷在于，土地储备机构职能权限存在不足，仅明确授权土地储备机构行使土地收购的职能，并未授权其他如行使土地收回、优先购买权、土地征收的职能，且实践中不同类型的国有独资企业以及其他土地储备机构不仅在土地征收等过程中成为主体，而且实施了土地储备，其职能权限较为模糊；储备整治工作资金保障机制不健全，银行借贷资金在所有资金来源中的占比较大，无法全面保障项目征、拆工作资金需求等；国土空间规划引领土地储备整治工作机制尚未建立，对土地供应和整治工作规划统筹不足等；土地储备前期开发、系统性风险问题未得到足够重视，面临宏观经济下行、土地价值下跌等风险以及受到市县两级财税体制限制等。针对这些不足，本文提出应当完善土地储备组织治理体系、土地储备资金融资体系、土地增值收益分配体系、城市空间治理体系和加强土地储备系统性风险应对等措施，以期推动土地储备治理体系的优化和发展。