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地方病一直是严重威胁着我国广大农村地区人群健康最主要的一类疾病,在地方病领域存在的共同问题是发病机理大多不是很清楚,有些疾病的病因仍不清楚.病因不清则不能从根本上找到对疾病的防治措施,而发病机理不清仍然是疾病防治过程中的最大障碍.可见,对地方病的病因及发病机制的研究仍然是地方病工作的最重要而且是最艰巨的任务.本文以我国典型的地方病病种:地方性砷中毒、地方性氟中毒、大骨节病、碘缺乏病、克山病为例,对功能蛋白质组学研究在地方病防治领域的研究前景加以展望.