金针菇小G蛋白Ran的序列特征与表达分析

来源 :食用菌学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：fengliufeng

【摘要】

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基于金针菇（Flammulina velutipes）基因组和转录组数据，运用本地BLAST方法，找到一个小G蛋白Ran的编码基因，命名为FvRan1。运用生物信息学方法进行分析，结果显示：该基因全长为1337bp，

【作者】

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张磊仝宗军严俊杰黄蓉梅刘媛媛李冰玉汪健芳谢宝贵

【机构】

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福建农林大学生命科学学院菌物研究中心

【出处】

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食用菌学报

【发表日期】

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2018年1期

【关键词】

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金针菇 Ran蛋白菌柄伸长重力刺激荧光定量PCR Flammulina velutipes FvRan1 stipe elongation micr

【基金项目】

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国家“973”项目（2014CB138302）

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基于金针菇（Flammulina velutipes）基因组和转录组数据，运用本地BLAST方法，找到一个小G蛋白Ran的编码基因，命名为FvRan1。运用生物信息学方法进行分析，结果显示：该基因全长为1337bp，编码区长度为1079bp，包含7个外显子和6个内含子，其中4个内含子（11、12、13、16）在mRNA加工过程中存在可变剪切现象。通过氨基酸序列同源比对和系统发育分析发现，FvRanl具有5个G-Box保守结构域和2个效应器开关，与担子菌中Moniliophthora roreri以及Tra

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