【摘 要】
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提出了1种判别标记肽假阳性的方法,根据同位素分布的概率原理计算出不同标记效率下的理论同位素分布,利用最小二乘法拟合得到标记肽的标记效率,根据标记肽的假阳性阈值来判断
【机 构】
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上海交通大学生命科学技术学院,复旦大学生物医学研究院
【基金项目】
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上海市科委国际合作项目(06SR07109),国家(“十五”)科技攻关项目资助(2002BAC11A11,2004BAT11A19),国家自然科学基金资助项目(20328508,30670574),国家高科技研究发展计划(863)项目资助(2006AA020805)
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提出了1种判别标记肽假阳性的方法,根据同位素分布的概率原理计算出不同标记效率下的理论同位素分布,利用最小二乘法拟合得到标记肽的标记效率,根据标记肽的假阳性阈值来判断标记肽的假阳性,并使用本方法判断了比较蛋白质组试验中的3个标记肽.结果表明,在这3个标记肽中有2个阳性标记肽结果,1个假阳性标记肽,说明此方法简单可靠,可用于判定标记肽的假阳性,衡量标记肽和正常肽之间的相似性,判断质谱峰型的变化,排除标记肽假阳性对蛋白质定量的影响.
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