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以堇菜属17种植物为试材，建立了适合堇菜属植物研究的AFLP反应体系。采用改良的SDS法提取堇菜属植物总DNA，对堇菜AFLP银染反应体系进行优化。在提取液中加入届一巯基乙醇，PVP可有效去除酚类等物质，以满足AFLP分析标记对基因组DNA的纯度高、完整性好的要求。37℃下酶切6h可以将基因组DNA完全切开，预扩增产物稀释35倍作为选择性扩增模板效果好，扩增产物经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，通过银染，能得到清晰的指纹式样。