【摘 要】
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目的:探讨炎症性肠病相关结肠癌患者的肿瘤组织及癌周组织的基因表达差异。方法:收集2016年1月至6月经术后病理学确诊为结肠腺癌合并克隆恩病或溃疡性结肠炎3例患者的石蜡包埋
【机 构】
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复旦大学附属中山医院肿瘤内科,复旦大学附属中山医院病理科
【基金项目】
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国家自然科学基金(81502003,81602038,81772511)~~
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目的:探讨炎症性肠病相关结肠癌患者的肿瘤组织及癌周组织的基因表达差异。方法:收集2016年1月至6月经术后病理学确诊为结肠腺癌合并克隆恩病或溃疡性结肠炎3例患者的石蜡包埋组织(FFPE);采用Illumina Hiseq平台对3例患者肿瘤组织和癌周组织进行测序,分析基因表达差异,并进行Pathway功能分类和富集分析;采用炎症性肠癌动物组织进行差异基因验证。结果:测序数据经过滤后,保存半年内的石蜡包埋组织标本的碱基含量分布及质量分布均符合分析要求,且样品间数据具有可比性。肿瘤组织和癌周组织间的差异表达基因
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