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港航后勤服务要素是港口体系的重要支撑,两者的相互协同有助于港口区域的可持续发展。为了识别港航后勤服务要素与港口体系的协同关系,运用DEA模型对长江三角洲地区主要城市港航后勤服务要素与港口体系的协同效率进行实证分析。研究结果显示：（1）长江三角洲地区各城市的港航后勤服务要素与港口体系协同效率存在较大差异;（2）宁波舟山的协同性最好,而上海、南通、苏州和南京均存在不同程度的协同效率问题;（3）部分城市存在资源投入过多和港口集装箱吞吐量不足的问题,最后针对港航后勤服务要素配置与港口产出不足提出相关建议。