子痫前期胎盘组织环状RNA表达谱的鉴定、验证与分析

来源 :重庆医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jjuuhhuu
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目的:本研究旨在描绘人胎盘组织中环状RNA(circular RNA,circRNA)的表达谱,发现并验证子痫前期胎盘组织异常表达的circRNA,研究分析其可能的调控网络。方法:利用高通量测序技术对子痫前期和正常胎盘组织中RNA进行测序和鉴定分析,并利用DeSeq2进行差异性分析。然后利用real-time quantitative PCR(qRT-PCR)在组织水平上对分析结果进行验证。随后利用生物信息学对验证的差异性circRNA进行gene ontology(GO)分析和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路分析。结果:测序结果显示,与正常胎盘组织相比,重度子痫前期胎盘共检测出300种异常表达的circRNA,包括151种高表达和149种低表达。qRT-PCR验证结果显示hg38circ0014736(1.4180±0.1065 vs.1.0440±0.1271,P=0.035)和hsacirc0015382(0.8958±0.1802 vs.0.6888±0.0253,P=0.025)在子痫前期胎盘组织中高表达,hsacirc0007121 (0.3958±0.2004 vs.1.3010±0.2407,P=0.000)在子痫前期胎盘组织中明显下调。生物信息学分析显示这些异常表达的circRNA与预测到的靶miRNA及靶基因可能参与调节细胞增殖、缺氧应激、转录后调控等功能。结论:与正常胎盘组织相比,子痫前期胎盘组织存在异常表达的circRNA。生物信息学分析显示,这些异常表达的circRNA或可以通过某些通路参与子痫前期发病。
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