【摘 要】
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根据我们之前的萱草(Hemerocallis fulva)转录组测序结果,采用生物信息学方法筛选用于实时荧光定量PCR的候选内参基因,并以萱草的根、茎、幼叶和三个发育阶段的花(长度约4 cm
【机 构】
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上海应用技术大学生态技术与工程学院,上海201418;上海市农业科学院林木果树研究所上海设施园艺技术重点实验室,上海201403
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根据我们之前的萱草(Hemerocallis fulva)转录组测序结果,采用生物信息学方法筛选用于实时荧光定量PCR的候选内参基因,并以萱草的根、茎、幼叶和三个发育阶段的花(长度约4 cm的幼嫩花蕾、长度约7 cm的即将开放的花蕾和开放的花朵)为材料,通过实时荧光定量PCR (qRT-PCR)测定通过转录组分析筛选到的6个候选内参基因(HfADF、HfTUB、HfGAPDH、HfTIP41、 HfEF-1α和HfUBQ)在各样品中的表达量.使用统计软件geNorm、NormFinder和BestKeeper对上述6个候选内参基因进行了评估.结果 表明:这些候选内参基因在不同样品中的表达量存在明显差异,适用于萱草不同器官研究的最优内参基因为HfTIP 41和fGAPDH.本研究首次评价了萱草内参基因稳定性,为该物种基因表达分析提供参考.
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