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2015年10月23日,财政部发布了《政府会计准则——基本准则》(财政部令78号),正式将权责发生制引入政府会计核算之中,实现了财务会计和预算会计的双重功能,采用"权责发生制"和"收付实现制"双重核算基础,对收支进行"平行记账"。本文依据《政府会计制度一行政事业单位会计科目和报表(征求意见稿)》,以科学事业单位实际业务的具体实践经验为例,就"待处理"、"预提费用"、"固定资产"、"无形资产"、"增值税"、"净资产类"科目设置和使用等方面提出了科学事业单位在新旧政府会计制度过渡衔接中存在的问题及拟解决的方案,以期对我国政府会计改革实践提供指导与借鉴。