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黑龙江省农垦科学院经济作物研究所主要从事马铃薯、油菜、食用菌、蔬菜、花卉、中草药、杂豆等作物的品种资源收集整理，利用分子技术和常规技术进行优良品种选育及配套技术措施的研究。目标是建立黑龙江省及垦区马铃薯、油菜，林下经济等一些特色经济作物的科技支撑体系，为黑龙江省及垦区经济作物的稳定发展及优势特色作物的崛起奠定基础。