基于水稻基因组序列SSR的多态性分析

来源 :中国水稻科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：kaokao514

【摘要】

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根据Monsanto公司所发布的6655个序列[由简单重复序列(SSR)及其两翼各100个碱基组成],通过生物信息学的方法,找到了在籼稻(Oryza sativa subsp.indica)品种93-11与粳稻(Oryza

【作者】

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陈仲中汪旭升朱军

【机构】

：

浙江大学生物信息学研究所

【出处】

：

中国水稻科学

【发表日期】

：

2005年4期

【关键词】

：

简单重复序列水稻多态性 simple sequence repeat rice polymorphism

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根据Monsanto公司所发布的6655个序列[由简单重复序列(SSR)及其两翼各100个碱基组成],通过生物信息学的方法,找到了在籼稻(Oryza sativa subsp.indica)品种93-11与粳稻(Oryza sativa subsp.japonica)品种日本晴的基因组序列中匹配最好的1453个同源位点.在这些位点中,93-11和日本晴中分别搜索到了1449个和1451个SSR.通过对SSR的分类比较,发现在93-11和日本晴的相同位点存在1175个具有相同基序的SSR,其中371个具有相

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